从审计情况看，社保基金还有一些历史遗留问题尚未解决，有些地方未能严格执行国务院有关规定。此次审计发现的违规问题金额，在1999年前发生的23.47亿元，2000年以来发生的47.88亿元。
部分社保机构违规建办公楼，基金无法追回
其具体情况是，1999年前发生的违规问题金额大多是涉及保险基金安全和完整的问题。其中动用保险基金对外投资11.48亿元；购建办公用房、职工宿舍和其他房产3.77亿元；委托金融机构贷款未收回1.89亿元；用于规定范围以外的支出1.25亿元；经商办企业0.68亿元；弥补行政经费0.33亿元和违规担保0.22亿元……另有原行业基本养老保险统筹基金结余未移交财政专户存储等3.76亿元。当时三项保险基金财务会计制度尚不健全，一些地方出于保险基金保值、增值的需要，出借和投资了一部分基金；有些社保机构动用三项保险基金购建了办公用房或其他一些房产，既无法变现，也没有正常的资金来源归还基金。以上问题虽经有关部门查处，但因种种原因部分基金至今不能收回。
2000年来违规贷款投资超5亿
2000年以来发生的违规问题金额47.88亿元。其中，扩大三项保险基金开支范围用于弥补“补充医保基金”及借给企业等16.69亿元；用于委托金融机构贷款、对外投资等5.44亿元；用于购建办公房及弥补行政经费等0.32亿元；未按规定实行专户管理23.37亿元。
此外，审计还发现一些地方基金管理不够规范。一是社保费代征机构未按规定时间将保险基金收入16.20亿元交入专户；二是社保经办机构在决算中少计保险基金收入8.12亿元。
-曝光
河南宁夏贵州被点名
违规行为包括转移至亲友等，金额超过1.02亿元
这次审计也发现个别地方由于保险基金管理混乱，造成损失。如河南新密市将企业职工养老保险基金637万元存入两家城市信用社，由于2002年11月信用社撤销，资金面临损失。宁夏石嘴山市医保中心自2000年以来，会计资料管理混乱，账目不全，部分凭证缺失，该中心主任和财务科长采取截留银行承兑汇票的手法，将某企业交给医保中心的3190万元医疗保险费转移到其亲戚、朋友名下。另外，审计还发现，有些行业主管部门存在截留社保费的问题。如建行贵州省分行与工行贵州省分行少申报缴费基数，在征得贵州省社保局的同意后，对已提取的基本养老保险费和失业保险费6422.64万元予以截留。
-整改
明年一季度前上报整改情况
审计署建议1999年前无法清收资金由同级政府偿还
针对审计中发现的问题，审计署建议，各级政府一定要严格基金管理，限期整改此次审计查出的问题，严肃追究有关责任人的责任。明年一季度前，把整改情况通报审计署，审计署将于适当时候公告各地整改情况。
这次审计发现1999年以前发生的挤占挪用、违规出借和投资等问题，由于种种原因至今尚未处理。为保证保险基金的安全完整，建议各级劳动保障部门对所有侵占保险基金的问题认真进行清理，采取措施积极清收。如果确实已经造成损失，无法清收的，由同级政府予以偿还，确保基金安全完整。
建议提出，要努力扩大征缴面，逐步提高保险基金的统筹层次。总体看，目前征缴面还未达到国家规定的水平，绝大多数地区的社会保险仍然是市县统筹，使社会保险关系接续困难，影响人才流动，阻碍全国统一市场的形成和企业改革的进一步推进。
-立法
社保基金管理条例纳入立法日程
争取与制订中的《社会保险法》同步出台
针对22日国务院常务会议做出“社会保险基金是条‘高压线’，任何人都不得侵占挪用”等指示，劳动和社会保障部透露，《社保基金管理条例》现在已纳入立法日程，将争取与制订中的《社会保险法》同步出台。各地也在采取措施完善管理制度。
劳动和社会保障部基金监督司司长陈良认为，社保基金出现问题，首先是基金监管法规不完善。目前，对社保基金的管理只有《劳动法》中有概括性规定。此外，还有一些文件和规定，但都停留在部委一级，法规层次不高，缺乏对违规行为的有效制约。
其次管理力量和手段有限。有些地区的基层甚至没有计算机，只能人工记账。另外社保基金管理人手极少，全国基金监管人员不到100人。如广东某市只有1个人管理着1.7万家企业的工伤保险工作。
此外，有些人法制、政策观念淡漠；还有监督不到位。
-保障
三项保险基金结余2918亿
截至去年养老保险基金、失业保险基金保障4000余万人
根据审计署的公告，截至2005年底，三项保险基金累计结余2918亿元。
此次审计的省本级、省会城市、计划单列市及部分延伸城市三项保险基金2005年收入3128.46亿元、支出2203.14亿元，分别占全国当年基金收支总额的50.7%、46.5%。截至2005年底，三项保险基金累计结余2918亿元。
2005年，全国三项保险的参保人数分别达到15716万人、13783万人和10648万人。
2005年，全国基本养老保险基金和失业保险基金的发放保障了4367万离退休人员和362万失业人员的基本生活，减轻了企业负担，促进了经济社会的健康发展，维护了社会的稳定。
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