会议认为，为适应机构改革和环境保护工作的需要，促进环境保护部工作的科学化、规范化、制度化，根据《国务院工作规则》的规定和环境保护部组建后面临的形势和任务，在认真总结实践经验的基础上，制定《环境保护部工作规则》是十分必要的。修改后的《工作规则》共十三章五十九条，它进一步明确了环境保护部工作的指导思想和职责，规范了内部工作程序，强化了对会议和重大活动的审批管理，同时还对环境保护部的部门规章、规范性文件和环境保护标准实施进行后评估，以及政务公开、廉政建设等做出了明确规定，体现了坚持依法行政、转变职能、从严治部的要求。会议决定，该规则经进一步修改后出台施行。
周生贤指出，十一届全国人大一次会议批准组建环境保护部，充分体现了党中央、国务院对环境保护工作的高度重视，代表了全国人民的意志，反映了广大人民群众的根本利益。面对党和人民的信任与重托，面对繁重的工作任务，必须进一步增强责任感和使命感，坚定信心，勤勉尽责，知难而进，兢兢业业、干干净净地为国家和人民工作，举全局之力推进环境保护历史性转变，为科学发展保驾护航，为人民健康鞠躬尽瘁。
周生贤强调，环境保护部当前和今后一个时期工作的指导思想和总的任务是:全面贯彻党的十七大精神，高举中国特色社会主义伟大旗帜，以邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导，深入贯彻落实科学发展观，以解决危害群众健康和影响可持续发展的突出环境问题为重点，加大污染减排工作力度，让不堪重负的江河湖海休养生息，保障群众饮用水安全；全面实施三大基础性、战略性工程，科学编制并组织实施“十二五”环保规划；继续开展机关“五大建设”，造就一支政治素质好、业务水平高、奉献精神强的环保队伍，全力推进历史性转变，加快建设资源节约型、环境友好型社会。
周生贤指出，今年是全面贯彻党的十七大精神的第一年，是实现“十一五”减排目标的攻坚年。要按照刚刚结束的十一届全国人大一次会议精神和《国务院2008年工作要点》的要求，认真扎实地做好各项工作，切实完成好党中央、国务院赋予的各项任务，促进经济社会又好又快发展。当前，要着力做好以下工作:
第一，要抓紧提出和落实好“三定”方案。“三定”方案批准后，要以此为契机，进一步转变职能，突出重点，改进方法，优化结构，完善机制，提高效率。要切实加强机构改革的组织领导，统筹兼顾，保证机构改革、业务工作“两不误、两促进”。
第二，努力完成污染减排目标。一要着力推进结构减排，配合有关部门完成关停小火电、淘汰炼钢、水泥、炼铁、造纸、酒精等落后产能的任务。二要着力推进工程减排，下功夫抓好促进度、保质量、抓运营三个环节，加大工业废水治理力度，按计划完成燃煤电厂3000万千瓦以上机组脱硫设施安装工程和1000平方米钢铁烧结机烟气脱硫工程。三要着力推进管理减排，通过加强环境监管，加大执法力度，引导企业开展清洁生产，发展循环经济。
第三，建立完善环境经济政策体系。积极配合有关部门适当提高排污费、污水和垃圾处理费标准，研究设立环境税，开展排污权交易、生态补偿试点，制定高污染产品目录，深化绿色信贷、绿色证券和绿色保险等工作，综合运用环境经济政策推进减排工作。
第四，努力为北京奥运会提供优良的环境保障。加大协调周边省市共同行动的力度，进一步完善区域联防机制，减少施工扬尘、机动车尾气、工业企业、燃煤锅炉和生活污染，坚决落实北京奥运会环境质量保障各项措施。
第五，加大力度保障群众饮水安全。进一步落实让不堪重负的江河湖海休养生息的政策措施，提高环境准入“门槛”，加强饮用水源保护，加大重点工业污染源治理力度，加快城镇污水处理设施建设，合理开发利用水资源，在太湖、巢湖、滇池等重点湖库区开展生态安全评估，提出“一湖一策”的综合治理方案。坚决依法取缔保护区内的排污口，确保今年年底实现113个环保重点城市地表水集中式饮用水源地主要指标达标率100％的目标。
第六，切实维护群众环境权益。继续深入开展环保专项行动，完善环保后督察机制，重点监管城市污水、垃圾集中处理设施和化工、造纸、电力、钢铁行业，严厉打击危及群众饮水安全的环境违法行为。
第七，认真做好全国污染源普查、环境宏观战略研究和水体污染治理与控制重大科技专项等基础性、战略性工作，为环境保护事业提供强有力的基础和科技支撑。
第八，深化机关“五大建设”。继续在统一思想、转变作风，理顺机制、强化培训、建章立制上下功夫，为机构改革和各项工作任务的顺利完成提供有力的思想、作风、组织、业务和制度保障。
周生贤最后强调，为了适应机构改革的新形势、新任务，必须在领导作风、思想作风、工作作风上有一个大的转变。一要坚持科学决策，提高决策水平和执行力；二要坚持任人唯贤，形成朝气蓬勃、奋发有为的领导集体；三要坚持令行禁止，确保中央政令和各项决策在环保系统畅通无阻；四要坚持规范程序，提高办事质量和工作效率；五要坚持权责统一，严格责任追究；六要坚持顾全大局，加强团结；七要坚持理论学习，提高工作能力和水平；八要坚持廉洁自律，做遵纪守法的模范。
环境保护部副部长潘岳、张力军、吴晓青、周建、李干杰，纪检组长傅雯娟，党组成员祝光耀同志参加会议。
环境保护部机关各部门主要负责同志，在京直属单位、派出机构主要负责人列席会议。
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